\usepackage{amsmath} kodunu kullanmadan önce aşağıdaki satırları eklerseniz sorun düzelecektir.

[pastacode lang=”markup” manual=”%5Cexpandafter%5Clet%5Ccsname%20equation*%5Cendcsname%5Crelax%0A%5Cexpandafter%5Clet%5Ccsname%20endequation*%5Cendcsname%5Crelax” message=”” highlight=”” provider=”manual”/]

Kaynak: http://randomusefulthoughts.blogspot.com/2016/02/latex-package-clash.html