Kategori Arşivi Latex

Mendeley kurulum ve Latex ile kullanımı

Bir önceki yazımda Latex kurulumundan ve nasıl kullanılacağına başlangıçtan bahsetmiştim. Bu yazımda ise Mendeley programından ve Latex ile birlikte kullanımından söz edeceğim. Mendeley programını makalelerinizi okumak ve paylaşmak, literatür oluşturmak ve referans vermek için kullanabileceğiniz çok kullanışlı bir yazılımdır. Ben referans vermek için nasıl kullanılabileceğinden bahsedeceğim. Kurulum ve kullanım için aşağıdaki adımları takip edebilirsiniz.

  • Öncelikle Mendeley websitesine girip Create Account diyerek bir hesap oluşturuyoruz.
  • Daha sonra Download menüsünden Mendeley programını indiriyoruz ve kuruyoruz (ben şu an için Windows versiyonunu indirip kurdum, Linux versiyonunu da deneyeceğim).

Program kurulumu tamamlandı. Şimdi amacım bir bibliyografi oluşturarak bu bibliyografiyi Latex’te referans vermek ve referanslar bölümü için kullanmak. Bunun öncelikle Mendeley programında Tools > Options menüsüne giriyoruz.

Açılan menüde Enable BibTeX syncing seçeneğini seçiyoruz ve ardından Create one BibTeX file per group diyoruz. Dosyayı nereye kaydedeceğini belirliyoruz. OK‘e basıp pencereyi kapatıyoruz. Böylelikle oluşturduğumuz her grup için otomatik olarak bir BibTeX oluşacak. Ben her yayın için bir grup oluşturmayı düşünüyorum.

Öncelikle sol taraftaki menüde bir grup (bioinformatics_makale) oluşturdum. Sonrasında yayında kullanacağım tüm makaleleri bu klasörün içerisine attım. Referans vereceğiniz her makale elinizde bulunmayabilir bu durumda Literature Search‘e tıklayarak makale isminde arama yapabilir bulduğunuz makaleyi Save Reference ile dökümanlarınıza kaydedebilir ilgili klasörünüze taşıyabilirsiniz. Klasörünüzü tamamıyla oluşturduğunuzda daha önce belirttiğiniz dizinde grupisminiz.bib (benim grubum için bioinformatics_makale.bib) şeklinde dosyanın oluştuğunu göreceksiniz (Ayrıca Literature Search’ten bulamadğınız makale olursa bu durumda Google Akademik’ten makaleyi bulup BibTeX formatında alıntı yap diyip bu alıntıyı kopyalayabilir daha sonra .bib uzantılı dosyanızı bir text editörde açıp bu dosyaya ekleyebilirsiniz).

Bu dosyayı Latex’te kullanmak için öncelikle makaleyi oluşturduğum Latex dizinine bu dosyayı kopyaladım. Daha sonra Tex Studio’da .tex uzantılı main dosyama geldim ve en alt kısmına aşağıda komutlarla bibliyografi dosyamı girdim. İlk satır referans stilimi gösteriyor. Bu sizin yazdığınızı dergiye göre değişiklik gösterebilir. İkinci satır ise referansların hangi dosyadan alınacağını belirtiyor.

\bibliographystyle{natbib}
\bibliography{bioinformatics_makale}

Şimdi gelelim yazı içerisinde nasıl referans vereceğimize. Her hangi bir yerde referans vermek istediğimizde \citep komutunu yazıyoruz. Yazar yazmak otomatik tamamlamada ilgili bibliyografi dosyasındaki tüm referanslar geliyor. Biz buradan istediğimiz referansı seçiyoruz. Referansı seçtiğimizde komut \citep{Altschul1997} şeklinde oluyor.

Ayrıca seçtiğimiz referans makalenin en sonunda referanslar bölümüne de otomatik olarak eklenmiş oluyor.

Referansların yazım stili daha önce bahsettiğim \bibliographystyle komutu ile değiştirilebilir. Size uygun biçimi seçmelisiniz. Ayrıca referans vermek için kullanacağınız farklı komutların olduğunu da unutmayın. Bunlar; citet, citep, citealt, citealp komutlarıdır. Referansların metin içerisinde görünümünü bu komutları kullanarak değiştirebilirsiniz.

Latex başlangıç

Malumunuz akademik çalışmalar yapıyorsanız tez, makale, bildiri vs. yazmanız gerekmektedir. Bu konularla uğraşanlar genellikle Microsoft Office Word yada Libre Office Writer ile başlarlar. Fakat bir müddet uğraştıktan sonra görürler ki ekleme çıkarma esnasında yazı oraya kaydı, resim buraya kaydı derken iş içinden çıkılmaz bir hal almakta çok fazla zaman kaybı olmaktadır. Yıllarca kendisinden haberdar olduğum ama dışarıdan karmaşık göründüğünden dolayı kullanmadığım LaTeX’e sonuçta el atmış bulunmaktayım. Bu amaçla öncelikle internette birkaç yazı okudum. Sonrasında kurulumun nasıl olacağını anlatan link‘teki yazıdan yararlanarak programı kurdum. Bu sebepten dolayı ilgili yazının yazarına paylaşımından dolayı teşekkür ediyorum. Kurulum esnasında onun izlediği yöntemi kullandım. Bu yazıyı yazmamdaki amaç ise kurulum adımlarının blogumda da bulunmasını istiyorum. Yine malumunuz konu hakkında Türkçe kaynak çok fazla bulunmuyor. Bu sebepten dolayı ilerleyen zamanlarda LaTeX kullanımına ve ipuçlarına dair yazılarım olacaktır. Aşağıda kurulum esnasında izlediğim adımlar bulunmaktadır.

  1. MikTeX kurulumu
  2. Ghostscript kurulumu
  3. GSview kurulumu
  4. Editör olarak TeXstudio kurulumu

Bu adımlardan sonra kurulum tamamlanmıştır. Peki bu aşamadan sonra nasıl bir başlangıç yaptım. Öncelikle makale hazırladığım derginin sitesinden Latex şablonunu indirdim ve şablon içerisinde tablo, figür, başlık, referans örnekleri olduğundan dolayı onları düzenleyerek yazmaya başladım. İhtiyacım olduğu yerlerde arama yaparak sorunları çözdüm. Bundan sonraki süreçte Latex’te karşılaştığım problemleri ve çözüm yollarını buradan paylaşacağım.

Kurulum için yararlandığım kaynak adresi: http://asuyatuyolar.org/2011/07/latex-nasl-kurulur